棉花基质穴盘育苗技术优点：省力、省工、省种、省床、省肥，出苗率高，苗病较轻、运输简单、移栽轻便，是对传统营养钵育苗技术的改革和创新。棉花基质穴盘育苗流程分为苗床制备、适期播种、苗床管理、棉苗移栽四个步骤。
     一、苗床制备
1.选择背风向阳、管理方便、靠近棉田或房前屋后、光照充足的地方建设。苗床规格可大可小。一般每6亩大田做8米长、2.8米宽，高度1.5-1.6米的棚（可借用蔬菜大棚）。中间留40厘米操作跑道，两边各横摆2张盘。床底要平，铺上农膜，便于水分管理，防止棉根下扎，方便取苗。
2.采用100孔穴盘，长595毫米、宽320毫米、高40毫米。
3.育苗基质选择疏松、保水、肥效长的，目前临近供应的有东台市奥丰育苗基质加工厂、海安瑞华生物工程有限公司、淮安淮农农业科技开发有限公司等企业供应的基质，育苗面积较大的专业户可实地考察选择。每袋50升，每亩大田苗床需1.5袋左右。
     二、适期播种
1.适宜播期在4月10日前后气温稳定后，可根据茬口、适宜苗龄25-30天倒推。面积大的要分期播种，方便供苗。
2.基质装盘。将干净水倒入基质搅拌均匀，含水量达到基质重量的60%（手捏成团，手指音不见流水、落地后自然散开），倒入育苗盘，然后用竹木条将育苗盘表面括平并填育均匀，上下紧实度一致。再将装好基质的第二个盘叠在第一个盘上，用一块平整的木板地第二个盘上用力压一下，这样第一张盘每穴中都会有一个小窝（依此类推），方便播种。
3.选取饱满健壮无破损的种子播种。每穴1粒，深度1.5-2.0厘米，种子水平或小头朝下摆放在孔穴正中，再用基质（湿度60%）覆盖至与盘表面平齐，按次序将穴盘平放在苗床中。
4.架棚、盖膜，四周用土密封。
     三、苗床管理
1.温度管理。播种后3天内大棚以封闲式管理为主，保证苗床增温足湿促齐苗。出苗到子叶平展期保持25℃左右，齐苗后，及时开启通风口，调节温度。真叶出生后温度保持在20-30℃。若气温超过30℃时，可在薄膜上盖遮阳网、草帘或稻草，防止高温烧苗；若气温低于17℃，则盖膜保温。
2.水分管理。水分运筹是基质育苗的核心技术。分3个阶段。第一阶段，播后5-10天，应保证水分充足，齐苗后浇定根水第二阶段。播后15-20天，控上促下，以不脱水不基本原则，一般每2天补一次水。第三阶段，播后25天左右，结合炼苗，干湿交替，进行抗旱锻炼，通过水分控制，把握棉苗生长发育进程。
3.病虫防治。子叶平展后，在第一片真叶抽出时，用壮苗素加敌杀死与多菌灵混合液进行适量喷施，防棉苗窜长，兼治蚜虫、盲蝽蟓和立枯病。
     四、棉苗移栽
1.移栽时间。棉苗移栽苗龄为2叶1心到4叶1心之间，以棉苗长至2叶1心为宜。移栽时，棉苗红茎比大于1/2，土壤墒情较好，地温达到18-20 0 C，选阴天或晴天下午4点以后移栽。
2.起苗。用手握住棉苗茎基部，轻轻向上将棉苗连同基质一起拔出，尽量保留全部基质，不能裸苗移栽。
3.移栽。用微型移栽钵器定密打塘，将棉苗放入打好的塘穴后，四周用细土壅实压紧，棉苗根系入土深5厘米左右。一边移栽一边浇水，如土壤墒情较差，要加大浇水量，确保棉苗及时活棵，缩短缓苗期。并提倡先铺地膜后栽棉苗，有利于棉苗早发快长。基质穴盘育苗棉苗移栽后，其大田管理同其他育苗方式的高产栽培相同。